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Enregistrement W2039406200 · doi:10.1371/journal.pbio.0020340

Genetic Analysis of Lice Supports Direct Contact between Modern and Archaic Humans

2004· article· en· W2039406200 sur OpenAlexfundno aff
David L. Reed, Vincent Smith, Shaless L Hammond, Alan R. Rogers, Dale H. Clayton

Notice bibliographique

RevuePLoS Biology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDermatological diseases and infestations
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaWellcome TrustLondon School of Hygiene and Tropical MedicineNational Science Foundation
Mots-clésBiologyLineage (genetic)Homo sapiensLouseEvolutionary biologyPopulationPhylogenetic treeZoologyAncient DNAPhylogeneticsHost (biology)GeneticsArchaeologyGeneDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Parasites can be used as unique markers to investigate host evolutionary history, independent of host data. Here we show that modern human head lice, Pediculus humanus, are composed of two ancient lineages, whose origin predates modern Homo sapiens by an order of magnitude (ca. 1.18 million years). One of the two louse lineages has a worldwide distribution and appears to have undergone a population bottleneck ca. 100,000 years ago along with its modern H. sapiens host. Phylogenetic and population genetic data suggest that the other lineage, found only in the New World, has remained isolated from the worldwide lineage for the last 1.18 million years. The ancient divergence between these two lice is contemporaneous with splits among early species of Homo, and cospeciation analyses suggest that the two louse lineages codiverged with a now extinct species of Homo and the lineage leading to modern H. sapiens. If these lice indeed codiverged with their hosts ca. 1.18 million years ago, then a recent host switch from an archaic species of Homo to modern H. sapiens is required to explain the occurrence of both lineages on modern H. sapiens. Such a host switch would require direct physical contact between modern and archaic forms of Homo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations268
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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