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Enregistrement W2039466442 · doi:10.1021/bi0361766

Identification of Novel Inhibitors of the SARS Coronavirus Main Protease 3CL<sup>pro</sup>

2004· article· en· W2039466442 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesBC Cancer AgencyUniversity of California, San FranciscoNational Institutes of Health
Mots-clésIsothermal titration calorimetryProteaseChemistryActive siteProteasesCoronavirusSerine proteaseBiochemistryEnzymeStereochemistryCombinatorial chemistryCoronavirus disease 2019 (COVID-19)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SARS (severe acute respiratory syndrome) is caused by a newly discovered coronavirus. A key enzyme for the maturation of this virus and, therefore, a target for drug development is the main protease 3CL(pro) (also termed SARS-CoV 3CL(pro)). We have cloned and expressed in Escherichia coli the full-length SARS-CoV 3CL(pro) as well as a truncated form containing only the catalytic domains. The recombinant proteins have been characterized enzymatically using a fluorescently labeled substrate; their structural stability in solution has been determined by differential scanning calorimetry, and novel inhibitors have been discovered. Expression of the catalytic region alone yields a protein with a reduced catalytic efficiency consistent with the proposed regulatory role of the alpha-helical domain. Differential scanning calorimetry indicates that the alpha-helical domain does not contribute to the structural stability of the catalytic domains. Analysis of the active site cavity reveals the presence of subsites that can be targeted with specific chemical functionalities. In particular, a cluster of serine residues (Ser139, Ser144, and Ser147) was identified near the active site cavity and was susceptible to being targeted by compounds containing boronic acid. This cluster is highly conserved in similar proteases from other coronaviruses, defining an attractive target for drug development. It was found that bifunctional aryl boronic acid compounds were particularly effective at inhibiting the protease, with inhibition constants as strong as 40 nM. Isothermal titration microcalorimetric experiments indicate that these inhibitors bind reversibly to 3CL(pro) in an enthalpically favorable fashion, implying that they establish strong interactions with the protease molecule, thus defining attractive molecular scaffolds for further optimization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,374

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle