Haplotype association and mutation analysis of the transglutaminase 1 gene for prenatal exclusion of lamellar ichthyosis
Notice bibliographique
Résumé
Lamellar ichthyosis (LI) is an autosomal recessive keratinization disorder of the skin. Genetic heterogeneity has been shown for the disease and there is evidence for the involvement of the transglutaminase 1 (TGM1) gene on chromosome 14q11. We have previously identified chromosome 14q11 haplotypes associated with ichthyosis in the Norwegian population. In this paper we describe antenatal exclusion of ichthyosis in two Norwegian families by chromosome 14q11 haplotype association and direct mutation analysis. In one pregnancy, the 11-week old fetus at risk for LI was found to share only one disease-associated haplotype. A subsequent mutation analysis of the TGM1 gene in fetal DNA revealed that the fetus carried a novel 3795A-->T transversion. The affected proband was compound heterozygous for the mutations 3795A-->T and 3239G-->C resulting in an Asp430Val and a Val379Leu, respectively. In another LI family, the 11-week old fetus was found to be heterozygous for the 14q11 haplotype associated with the disease. Subsequent mutation analysis revealed that the fetus was heterozygous for the 2526A-->G transition in the splice site of intron 5 whereas the proband was homozygous for the same mutation. Our results show that haplotyping can be a useful tool for prenatal diagnosis in diseases with genetic heterogeneity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».