Characterization of a human betaretrovirus in patients with primary biliary cirrhosis
Notice bibliographique
Résumé
Our laboratory has characterized and cloned a human betaretrovirus resembling the mouse mammary tumor virus (MMTV) from biliary epithelium and lymph nodes of patients with the autoimmune biliary disease, primary biliary cirrhosis (PBC). Evidence for betaretrovirus infection has been detected mainly in patients’ lymphoid tissue by RT-PCR and immunohistochemistry in approximately 75% of PBC patients. However, the viral burden was observed to be far less in the liver and we could only identify viral sequence in a third of patients using RT-PCR. Other labs have been unable to confirm our data using PCR of hepatic DNA. Not surprisingly, the betaretroviral association with PBC has become a controversial issue. In order to provide more robust evidence of infection in patients with liver disease, we have isolated an infectious betaretrovirus from lymph nodes. We cloned and sequenced the proviral isolates and confirmed viral particles by electron microscopy. We have also conducted ligation-mediated PCR studies with next generation sequencing and found proviral integration sites both in vivo and in vitro. To date, we have identified more than 3,000 integration sites in perihepatic lymph nodes, liver and isolated biliary epithelium in the majority of patients with PBC and seldom in patients with other liver diseases. These data confirm the presence of an MMTV-like virus in patients with autoimmune liver disease. Ongoing studies using biliary disease mouse models with MMTV infection and randomized controlled anti-retroviral trials for patients with PBC will be required to further characterize the association of human betaretrovirus infection with PBC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».