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Enregistrement W2039588855 · doi:10.1111/jam.12157

Temporal change in the gut community of rats fed high amylose cornstarch is driven by endogenous urea rather than strictly on carbohydrate availability

2013· article· en· W2039588855 sur OpenAlexafffund
Martin Kalmokoff, B. M. Zwicker, Matthew O’Hara, Fernando Matias, J. Green, Padmaja Shastri, Julia M. Green-Johnson, Stephen P.J. Brooks

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Microbiology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensOntario Tech UniversityHealth CanadaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesHealth CanadaAgriculture and Agri-Food CanadaOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural AffairsAdvanced Foods and Materials Network
Mots-clésBacteroidetesBiologyRuminococcusGut floraFood scienceFecesStarchAmyloseFirmicutesMicrobiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIM: To examine change in the gut community of rats fed high amylose maize starch (HAMS). METHODS AND RESULTS: Rats were fed AIN93G diets containing HAMS (5% resistant starch type 2) or alphacell (control). HAMS increased faecal short-chain fatty acid output, faecal propionate and total bacteria output but reduced gut pH and blood urea concentrations compared with rats ingesting the control diet. Feeding HAMS resulted in a gut community dominated by four phylotypes homologous with Ruminococcus bromii, Bacteroides uniformis and with yet to be cultivated organisms aligning into the Family Porphyromonadaceae. Enrichment of phylotypes aligning within the Bacteroidetes occurred primarily in the caecum, whereas those homologous with R. bromii were found primarily in the faeces. HAMS altered community structure such that the phylum Bacteroidetes represented the dominant gut lineage and progressively reduced faecal community phylotype richness over the duration of feeding. CONCLUSIONS: Feeding HAMS resulted in a caecal and faecal community dominated by organisms that require ammonia as a primary nitrogen source. Gut ammonia derived from endogenous urea represents an important factor contributing to caecal community composition in addition to the ability to utilize HAMS. Increases in faecal propionate, rather than butyrate as is often observed following resistant starch feeding, reflected a gut community dominated by the Bacteroidetes. SIGNIFICANCE: Diet-mediated change is often viewed strictly in terms of available carbohydrate. Here, we have shown that ammonia derived from endogenous urea is an important factor contributing to gut community composition and structure in rats fed this substrate.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil0,657

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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