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Enregistrement W2039623374 · doi:10.1038/nsmb.1972

An assessment of histone-modification antibody quality

2010· article· en· W2039623374 sur OpenAlexaff
Thea A. Egelhofer, Aki Minoda, Sarit Klugman, Kyungjoon Lee, Paulina Kolasinska-Zwierz, Artyom A. Alekseyenko, Ming-Sin Cheung, Daniel S. Day, Sarah Gadel, Andrey A. Gorchakov, Tingting Gu, Peter V. Kharchenko, Samantha Kuan, Isabel Latorre, Daniela Linder-Basso, Ying Luu, Queminh Ngo, Marc D. Perry, Andreas Rechtsteiner, Nicole C. Riddle, Yuri B. Schwartz, Gregory Shanower, Anne Vielle, Julie Ahringer, Sarah C. R. Elgin, Mitzi I. Kuroda, Vincenzo Pirrotta, Bing Ren, Susan Strome, Peter J. Park, Gary H. Karpen, R. David Hawkins, Jason D. Lieb

Notice bibliographique

RevueNature Structural & Molecular Biology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Human Genome Research InstituteNational Institutes of HealthWellcome Trust
Mots-clésAntibodyHistoneChromatin immunoprecipitationWestern blotDot blotCaenorhabditis elegansImmunoprecipitationDrosophila melanogasterChromatinMolecular biologyCell biologyHistone H2ABiologyChemistryGeneticsGeneGene expressionPromoter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,998
Score d'incertitude au seuil0,000

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,500
Écart entre enseignants0,494 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations444
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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