Probing Dynamic Conformations of the High-Molecular-Weight αB-Crystallin Heat Shock Protein Ensemble by NMR Spectroscopy
Notice bibliographique
Résumé
Solution- and solid-state nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy are highly complementary techniques for studying supra-molecular structure. Here they are employed for investigating the molecular chaperone αB-crystallin, a polydisperse ensemble of between 10 and 40 identical subunits with an average molecular mass of approximately 600 kDa. An IxI motif in the C-terminal region of each of the subunits is thought to play a critical role in regulating the size distribution of oligomers and in controlling the kinetics of subunit exchange between them. Previously published solid-state NMR and X-ray results are consistent with a bound IxI conformation, while solution NMR studies provide strong support for a highly dynamic state. Here we demonstrate through FROSTY (freezing rotational diffusion of protein solutions at low temperature and high viscosity) MAS (magic angle spinning) NMR that both populations are present at low temperatures (<0 °C), while at higher temperatures only the mobile state is observed. Solution NMR relaxation dispersion experiments performed under physiologically relevant conditions establish that the motif interchanges between flexible (highly populated) and bound (sparsely populated) states. This work emphasizes the importance of using multiple methods in studies of supra-molecules, especially for highly dynamic ensembles where sample conditions can potentially affect the conformational properties observed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».