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Enregistrement W2039796386 · doi:10.1021/ja902890r

<i>In Vivo</i> Formation of Protein Based Aqueous Microcompartments

2009· article· en· W2039796386 sur OpenAlexaff
Xin Ge, Andrew Conley, Jim Brandle, Ray Truant, Carlos D. M. Filipe

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensMcMaster UniversityAgriculture and Agri-Food CanadaWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryFusion proteinFluorescence recovery after photobleachingGreen fluorescent proteinIn vivoBiophysicsCytoplasmProtein aggregationProtein biosynthesisCell biologyBiochemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this paper, we report the formation of protein based liquid droplets resulting in the formation of in vivo microcompartments in E. coli or tobacco cells. These microcompartments were generated by expressing elastin-like polypeptides (ELP), which have the ability to undergo a reversible phase transition, resulting in the formation of an aqueous two-phase system (ATPS) in the cytoplasm of the cell. We prove that these microcompartments are liquid by expressing a fusion protein consisting of ELP and GFP and by performing fluorescence recovery after photobleaching (FRAP) experiments at different stages of cell cultivation. In the initial phases of cell growth, the fusion protein concentration is low and is not sufficient to drive the formation of a second aqueous phase. As the intracellular fusion protein concentration increases with longer cultivation time, droplets start forming, and as protein expression continues, the droplets coalesce at the poles of the E. coli cells. FRAP experiments with cells at different growth stages reveals that the protein in these ELP based droplets is comprised of aqueous and not solid aggregates, as seen in typical inclusion bodies. Staining of the ribosomes and coimaging of the ELP-GFP fusion protein showed that these compartments exclude the protein making machinery of the cell, acting as depots for newly formed protein. It is also shown, in vitro, that ELP based droplets result in the exclusion of proteases, protecting proteins from degradation. Additional studies are still required to test this possibility in vivo. To the best of our knowledge, this is the first report characterizing the formation of an engineered extra aqueous phase in a living organism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,196

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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