Molecular localization of a ribosome-dependent ATPase on Escherichia coli ribosomes
Notice bibliographique
Résumé
We have previously isolated and described an Escherichia coli ribosome-bound ATPase, RbbA, that is required for protein synthesis in the presence of ATP, GTP and the elongation factors, EF-Tu and EF-G. The gene encoding RbbA, yhih, has been cloned and the deduced protein sequence harbors two ATP-motifs and one RNA-binding motif and is homologous to the fungal EF-3. Here, we describe the isolation and assay of a truncated form of the RbbA protein that is stable to overproduction and purification. Chemical protection results show that the truncated RbbA specifically protects nucleotide A937 on the 30S subunit of ribosomes, and the protected site occurs at the E-site where the tRNA is ejected upon A-site occupation. Other weakly protected bases in the region occur at or near the mRNA binding site. Using radiolabeled tRNAs, we study the stimulating effect of this truncated RbbA on the binding and release of different tRNAs bound to the (aminoacyl) A-, (peptidyl) P- and (exit) E-sites of 70S ribosomes. The combined data suggest plausible mechanisms for the function of RbbA in translation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».