MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2040118502 · doi:10.1593/neo.04457

Inverse Relationship between 15-Lipoxygenase-2 and PPAR-γ Gene Expression in Normal Epithelia Compared with Tumor Epithelia

2005· article· en· W2040118502 sur OpenAlexfundno aff
Vemparala Subbarayan, Xiao-Chun Xu, Jeri Kim, Peiying Yang, Ashraful Hoque, Anita L. Sabichi, Norma Llansa, Christopher J. Logothetis, Robert A. Newman, Scott M. Lippman, David G. Menter

Notice bibliographique

RevueNeoplasia · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Cancer InstitutePublic Health Agency of Canada
Mots-clésBiologyMessenger RNAPeroxisome proliferator-activated receptorReceptorIn situ hybridizationMolecular biologyGene expressionHydroxyeicosatetraenoic acidEndogenyEnzymeLipoxygenaseGeneEndocrinologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

15-Lipoxygenase-2 (15-LOX-2) synthesizes 15-S-hydroxyeicosatetraenoic acid (15-S-HETE), an endogenous ligand for the nuclear receptor, peroxisome proliferator-activated receptor-gamma (PPAR-gamma). Several studies have described an inverse relationship between 15-LOX-2 and PPAR-gamma expression in normal versus tumor samples. To systematically determine if this is a ubiquitous phenomenon, we used a variety of epithelial and nonepithelial cells and some tissues to further evaluate the extent of this inverse relationship. The levels of mRNA or protein were measured by reverse transcriptase polymerase chain reaction or Western gray level intensity, whereas distribution was determined by in situ hybridization or immunofluorescence. 15-S-HETE was measured by liquid chromatography/tandem mass spectrometry. Normal epithelial cells/samples generally expressed high levels of 15-LOX-2 along with the enzyme product 15-S-HETE, but both levels were reduced in cancer cells/samples. In contrast, most cancer cells expressed high levels of PPAR-gamma mRNA and protein, which were absent from normal epithelial cells. Overall, the inverse relationship between these two genes was primarily restricted to epithelial samples. Forced expression of PPAR-gamma reduced 15-LOX-2 protein levels in normal cells, whereas forced expression of 15-LOX-2 in tumor cells suppressed PPAR-gamma protein levels. These results suggest that feedback mechanisms may contribute to the loss of 15-LOX-2 pathway components, which coincide with an increase in PPAR-gamma in many epithelial cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,333
Score d'incertitude au seuil0,906

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNeoplasiaMême sujetPeroxisome Proliferator-Activated ReceptorsTravaux en français237 207