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Enregistrement W2040452312 · doi:10.1002/pmic.200500066

Identification of prion protein binding proteins by combined use of far‐Western immunoblotting, two dimensional gel electrophoresis and mass spectrometry

2005· article· en· W2040452312 sur OpenAlex
Alexander Strom, Sebastian Diecke, Gerhard Hunsmann, Andreas W. Stuke

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePROTEOMICS · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensHealth Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGene isoformProteomicsBiologyRecombinant DNAMolecular biologyPrion proteinRibonucleoproteinGlycoproteinBiochemistryRNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cellular prion protein (PrP(C)), a highly conserved glycoprotein predominantly expressed by neuronal cells, can convert into an abnormal isoform (PrP(Sc)) and provoke a transmissible spongiform encephalopathy. In spite of many studies, the physiological function of PrP(C) remains unknown. Recent findings suggest that PrP(C) is a multifunctional protein participating in several cellular processes. Using recombinant human PrP as a probe, we performed far-Western immunoblotting (protein overlay assay) to detect cellular PrP(C) interactors. Brain extracts of wild-type and PrP knockout mice were screened by far-Western immunoblotting for PrP-specific interactions. Subsequently, putative ligands were isolated by 2-DE and identified by MALDI-TOF MS, enabling identification of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2/B1 and aldolase C as novel interaction partners of PrP(C). These data provide the first evidence of a molecule indicating a mechanism for the predicted involvement of PrP(C) in nucleic acid metabolisms. In summary, we have shown the successful combination of 2-DE with far-Western immunoblotting and MALDI-TOF MS for identification of new cellular binding partners of a known protein. Especially the application of this technique to investigate other neurodegenerative diseases is promising.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,761

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle