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Enregistrement W2040540467 · doi:10.1042/bj20030847

Palmitoylation is not required for trafficking of human anion exchanger 1 to the cell surface

2004· article· en· W2040540467 sur OpenAlexaff
Joanne C. Cheung, Reinhart A.F. Reithmeier

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensCanada Research ChairsUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPalmitoylationHEK 293 cellsTransfectionGolgi apparatusEndoplasmic reticulumCell biologyBiochemistryChemistryPalmitic acidGlycanGlycoproteinMutantMolecular biologyBiologyCysteineFatty acidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AE1 (anion exchanger 1) is a glycoprotein found in the plasma membrane of erythrocytes, where it mediates the electroneutral exchange of chloride and bicarbonate, a process important in CO2 removal from tissues. It had been previously shown that human AE1 purified from erythrocytes is covalently modified at Cys-843 in the membrane domain with palmitic acid. In this study, the role of Cys-843 in human AE1 trafficking was investigated by expressing various AE1 and Cys-843Ala (C843A) mutant constructs in transiently transfected HEK-293 cells. The AE1 C843A mutant was expressed to a similar level to AE1. The rate of N-glycan conversion from high-mannose into complex form in a glycosylation mutant (N555) of AE1 C843A, and thus the rate of trafficking from the endoplasmic reticulum to the Golgi, were comparable with that of AE1 (N555). Like AE1, AE1 C843A could be biotinylated at the cell surface, indicating that a cysteine residue at position 843 is not required for cell-surface expression of the protein. The turnover rate of AE1 C843A was not significantly different from AE1. While other proteins could be palmitoylated, labelling of transiently transfected HEK-293 cells or COS7 cells with [3H]palmitic acid failed to produce any detectable AE1 palmitoylation. These results suggest that AE1 is not palmitoylated in HEK-293 or COS7 cells and can traffic to the plasma membrane.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,196

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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