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Enregistrement W2040566502 · doi:10.1021/bi0478502

Spontaneous Curvature of Phosphatidic Acid and Lysophosphatidic Acid

2005· article· en· W2040566502 sur OpenAlexaff
Edgar E. Kooijman, Vladimir Chupin, N. L. Fuller, Michael M. Kozlov, Ben de Kruijff, Koert N.J. Burger, Peter R. Rand

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensBrock University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhosphatidic acidLysophosphatidic acidMembrane curvatureCurvatureChemistryMembraneDiacylglycerol kinaseBiophysicsBiochemistryLipid bilayerPhospholipidBiologySignal transductionReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The formation of phosphatidic acid (PA) from lysophosphatidic acid (LPA), diacylglycerol, or phosphatidylcholine plays a key role in the regulation of intracellular membrane fission events, but the underlying molecular mechanism has not been resolved. A likely possibility is that PA affects local membrane curvature facilitating membrane bending and fission. To examine this possibility, we determined the spontaneous radius of curvature (R(0p)) of PA and LPA, carrying oleoyl fatty acids, using well-established X-ray diffraction methods. We found that, under physiological conditions of pH and salt concentration (pH 7.0, 150 mM NaCl), the R(0p) values of PA and LPA were -46 A and +20 A, respectively. Thus PA has considerable negative spontaneous curvature while LPA has the most positive spontaneous curvature of any membrane lipid measured to date. The further addition of Ca(2+) did not significantly affect lipid spontaneous curvature; however, omitting NaCl from the hydration buffer greatly reduced the spontaneous curvature of PA, turning it into a cylindrically shaped lipid molecule (R(0p) of -1.3 x 10(2) A). Our quantitative data on the spontaneous radius of curvature of PA and LPA at a physiological pH and salt concentration will be instrumental in developing future models of biomembrane fission.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations297
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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