Terminal Structure Mediates 5 S rRNA Stability and Integration during Ribosome Biogenesis
Notice bibliographique
Résumé
Formation of the eukaryotic ribosomal 5 S RNA-protein complex has been shown to be critical to ribosome biogenesis and has been speculated to contribute to a quality control mechanism that helps ensure that only normal precursors are processed and assembled into active ribosomes. To study the structural basis of these observations, the RNA-protein interface in the 5 S RNA-protein complex of the yeast (Saccharomyces cerevisiae) ribosome was examined based on a systematic introduction of targeted base substitutions in the RNA sequence. Most base substitutions had little or no effect on the efficiency of complex formation, but large effects were observed when changes disrupted helix I, the secondary structure formed between the interacting termini. Again, only modest effects were evident when the extended 3' end of the mature RNA molecule was altered, but essentially no complex was formed when the 5' end of the mature 5 S RNA sequence was artificially extended by one nucleotide. In vitro analyses demonstrated that this extension also dramatically altered the maturation of 5 S rRNA precursor molecules as well as the stability of the mature 5 S rRNA. Taken together, the results indicate that in the course of RNA maturation, the 5 S RNA-binding protein binds precisely over or "caps" the termini in a critical manner that protects the RNA from further degradation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».