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Enregistrement W2040599805 · doi:10.1371/journal.pone.0055388

Localization of Lipid Raft Proteins to the Plasma Membrane Is a Major Function of the Phospholipid Transfer Protein Sec14

2013· article· en· W2040599805 sur OpenAlexafffund
Amy J. Curwin, Marissa A. LeBlanc, Gregory D. Fairn, Christopher R. McMaster

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research ChairsNova Scotia Health Research Foundation
Mots-clésPhospholipid transfer proteinPlant lipid transfer proteinsRaftLipid raftPhospholipidCell biologyMembrane proteinChemistryMembraneBiophysicsBiochemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Sec14 protein domain is a conserved tertiary structure that binds hydrophobic ligands. The Sec14 protein from Saccharomyces cerevisiae is essential with studies of S. cerevisiae Sec14 cellular function facilitated by a sole temperature sensitive allele, sec14(ts). The sec14(ts) allele encodes a protein with a point mutation resulting in a single amino acid change, Sec14(G266D). In this study results from a genome-wide genetic screen, and pharmacological data, provide evidence that the Sec14(G266D) protein is present at a reduced level compared to wild type Sec14 due to its being targeted to the proteosome. Increased expression of the sec14(ts) allele ameliorated growth arrest, but did not restore the defects in membrane accumulation or vesicular transport known to be defective in sec14(ts) cells. We determined that trafficking and localization of two well characterized lipid raft resident proteins, Pma1 and Fus-Mid-GFP, were aberrant in sec14(ts) cells. Localization of both lipid raft proteins was restored upon increased expression of the sec14(ts) allele. We suggest that a major function provided by Sec14 is trafficking and localization of lipid raft proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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