Phylogenetic analysis of<i>Bacillus thuringiensis</i>serovars based on 16S rRNA gene restriction fragment length polymorphisms
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
AIMS: To determine the 16S rRNA gene fingerprints of Bacillus thuringiensis strains to reveal phylogenetic relationships among them. METHODS AND RESULTS: Using 16S rRNA gene restriction fragment length polymorphisms generated by HindIII and EcoRI, 86 Bacillus thuringiensis strains were classified. This includes 80 B. thuringiensis serovars and five more strains, kurstaki HD-1, subtoxicus, dendrolimus, tenebrionis and sandiego, to assess not only interserovar DNA relatedness but also intraserovar DNA relatedness, and the non-motile strain, hence non-serotypeable, B. thuringiensis var. wuhanensis. All 86 B. thuringiensis strains tested showed distinct ribotypes. The dendrogram resulting from the numerical analysis of the distance matrix shows four distinct phylogenetic groups and two ungrouped serovars, finitimus and bolivia, at the 92.5% DNA relatedness rate. CONCLUSION: 16S rRNA gene fingerprinting cannot only be used for the classification of B. thuringiensis strains amenable or not to serotyping, but can also reveal phylogenetic relationships between strains. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: In future screening programmes, 16S rRNA gene restriction pattern analysis could be determined for novel B. thuringiensis strains, allowing them not only to be grouped but also to be positioned on the phylogenetic tree.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle