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Enregistrement W2040672289 · doi:10.1158/1538-7445.am2014-2094

Abstract 2094: Regulation of site-specific liver metastasis by collagen IV-conveyed signals

2014· article· en· W2040672289 sur OpenAlexaffabout
Roni Rayes, Ni Wang, Julia V. Burnier, France Bourdeau, Pnina Brodt

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAmphiregulinMetastasisCancer researchTranscriptomeBlotSmall hairpin RNAPathologyType IV collagenLungBiologyChemokineCarcinomaGene expressionMedicineCancerGeneImmunologyInternal medicineExtracellular matrixRNAInflammationCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The liver is a primary site of metastasis for some of the most common human malignancies. At present, surgical resection is the most effective curative option for liver metastases, but most patients with liver metastases still succumb to their disease. A better understanding of the underlying biology is essential for design of more effective therapy. We previously identified basement membrane type IV collagen α1/α2 expression levels as determinants of the liver colonizing potential in a murine lung carcinoma model (1) and observed high collagen IV expression levels in surgical specimens of liver metastases from diverse tumor types. The aim of this study was to elucidate the functional relevance of increased collagen IV expression to liver metastases formation. We reported that collagen IV α1/α2 overexpression in non-metastatic lung carcinoma M-27 (M27colIV) cells increased specifically their liver (but not lung) metastasizing potential. A transcriptome analysis was therefore performed on these cells in order to identify changes to gene expression that could account for the newly acquired metastatic potential. This analysis revealed that type IV collagen levels regulated the expression of multiple genes. Prominent among them were genes encoding for chemokines such as CCL-5 and CCL-7 and for growth factors such as amphiregulin (AREG) that were all upregulated by ≥ 3 fold. These changes were validated at the RNA and protein levels using qPCR and Western blotting, respectively. When the expression of these genes in M27colIV cells was subsequently silenced using shRNA, a significant decrease (5-10 folds) was observed in their ability to generate experimental liver metastases, as compared to wild type or mock-transfected cells and they failed to develop metastases in 40-50 % of injected mice. A similar correlation between CCL-5 and CCL-7 expression levels and liver metastases formation was also noted in human colon carcinoma cell lines. The results identify a type IV collagen-regulated gene expression signature that promotes liver metastasis and suggest that collagen IV-induced changes in chemokine and growth factor production levels mediate this effect. They provide a rationale for further exploration of the clinical utility of CCL-5, CCL-7 and AREG as targets in the management of liver metastases. Supported by a grant from the Canadian Institute for Health Research (to PB) and a Henry R. Shibata Cedars Cancer Fellowship (to RR). REFERENCES 1. Burnier JV, Wang N, Michel RP, Hassanain M, Li S, Lu Y, et al. Type IV collagen-initiated signals provide survival and growth cues required for liver metastasis. Oncogene. 2011;30:3766-83. Citation Format: Roni F. Rayes, Ni Wang, Julia V. Burnier, France Bourdeau, Pnina Brodt. Regulation of site-specific liver metastasis by collagen IV-conveyed signals. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr 2094. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-2094

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission2
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