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Enregistrement W2040756263 · doi:10.1002/humu.20433

Biochemical and molecular characterization of 18 patients with pyridoxine-dependent epilepsy and mutations of the antiquitin (ALDH7A1) gene

2006· article· en· W2040756263 sur OpenAlexaff
Barbara Plecko, Karl Paul, Eduard Paschke, Sylvia Stoeckler-Ipsiroglu, Eduard A. Struys, Cornelis Jakobs, Hans Hartmann, Thomas Luecke, M. Di Capua, Christoph Korenke, Christiane Hikel, Elke Reutershahn, Michael Freilinger, F. A. M. Baumeister, Friedrich Bosch, Wolfgang Erwa

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaBC Children's Hospital
Organismes subventionnairesMedizinische Universität Graz
Mots-clésMissense mutationPyridoxineNonsense mutationBiologyExonCompound heterozygosityGeneticsInternal medicineEpilepsyAlleleEndocrinologyMutationGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Patients with pyridoxine dependent epilepsy (PDE) present with early-onset seizures resistant to common anticonvulsants. According to the benefit of pyridoxine (vitamin B(6)) and recurrence of seizures on pyridoxine withdrawal, patients so far have been classified as having definite, probable, or possible PDE. Recently, PDE has been shown to be caused by a defect of alpha-amino adipic semialdehyde (AASA) dehydrogenase (antiquitin) in the cerebral lysine degradation pathway. The accumulating compound piperideine-6-carboxylic acid (P6C) was shown to inactivate pyridoxalphosphate (PLP) by a Knoevenagel condensation. Pipecolic acid (PA) and AASA are markedly elevated in urine, plasma, and cerebrospinal fluid (CSF) and thus can be used as biomarkers of the disease. We have investigated 18 patients with neonatal seizure onset, who have been classified as having definite (11), probable (four), or possible (three) PDE. All patients had elevated PA and AASA in plasma (and urine) while on treatment with individual dosages of pyridoxine. Within this cohort, molecular analysis identified 10 novel mutations (six missense mutations, one nonsense mutation, two splice site mutations) within highly conserved regions of the antiquitin gene. Seven mutations were located in exonic sequences and two in introns 7 and 17. Furthermore, a novel deletion of exon 7 was identified. Two of the 36 alleles investigated require further investigation. A known mutation (p.Glu399Gln) was found with marked prevalence, accounting for 12 out of 36 alleles (33%) within our cohort. Pyridoxine withdrawal is no longer needed to establish the diagnosis of "definite" PDE. Administration of pyridoxine in PDE may not only correct secondary PLP deficiency, but may also lead to a reduction of AASA (and P6C) as presumably toxic compounds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations167
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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