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Enregistrement W2040836057 · doi:10.1073/pnas.1214887110

Crucial role of the hydrophobic pocket region of Munc18 protein in mast cell degranulation

2013· article· en· W2040836057 sur OpenAlexafffund
Na‐Ryum Bin, Chang Hun Jung, Christopher Piggott, Shuzo Sugita

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésSyntaxinDegranulationCell biologyExocytosisBiologySecretionSyntaxin 3Mast cellMutantChemistryImmunologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The function of the Munc18-1 protein hydrophobic pocket, which interacts with the syntaxin-1 N-terminal peptide, has been highly controversial in neurosecretion. Recent analysis of patients with familial hemophagocytic lymphohistiocytosis type 5 has identified the E132A mutation in the hydrophobic pocket of Munc18-2, prompting us to examine the role of this region in the context of immune cell secretion. Double knockdown of Munc18-1 and Munc18-2 in RBL-2H3 mast cells eliminates both IgE-dependent and ionomycin-induced degranulation and causes a significant reduction in syntaxin-11 without altering expressions of the other syntaxin isoforms examined. These phenotypes were effectively rescued on reexpression of wild-type Munc18-1 or Munc18-2 but not the mutants (F115E, E132A, and F115E/E132A) in the hydrophobic pocket of Munc18. In addition, these mutants show that they are unable to directly interact with syntaxin-11, as tested through protein interaction experiments. Our results demonstrate the crucial roles of the hydrophobic pocket of Munc18 in mast cell degranulation, which include the regulation of syntaxin-11. We also suggest that the functional importance of this region is significantly different between neuronal and immune cell exocytosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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