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Enregistrement W2040844444 · doi:10.2135/cropsci2012.10.0614

Genetic Diversity and Population Structure in a World Collection of <i>Brassica napus</i> Accessions with Emphasis on South Korea, Japan, and Pakistan

2013· article· en· W2040844444 sur OpenAlexafffundabout
Sanjaya Gyawali, Dwayne D. Hegedus, Isobel A. P. Parkin, Jenny Poon, Erin E. Higgins, Kyla Horner, Diana Bekkaoui, Cathy Coutu, L. Buchwaldt

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaMinistry of Agriculture - Saskatchewan
Mots-clésGermplasmBiologyGenetic diversityChinaAnalysis of molecular variancePopulationBrassicaAlleleGenetic variationGenetic structureBiotechnologyBotanyGeneticsGeographyDemographyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Information on genetic diversity and population structure is needed for continued improvement in Brassica napus L. A total of 169 B. napus lines, collected between 1970 and 2000 in Australia, Canada, China, Europe, Japan, Pakistan, and South Korea, were genotyped with 84 simple sequence repeat markers. Nei's unbiased genetic diversity ( H ) and Shannon's information index ( SI ) showed that genetic diversity was highest among lines from Europe followed by South Korea, Japan, China, and Pakistan while lines from Australia and Canada had the lowest diversity. Pairwise comparison of the populations using Nei's genetic identity ( I ) and genetic distance ( D ) showed greater differentiation between Australia and Canada versus China and Pakistan. Accessions from South Korea and Japan were most similar, confirming an historical exchange of germplasm. The analysis of unique alleles and allele richness revealed that the Pakistani population was the richest followed by Europe and South Korea. Analysis of molecular variance revealed that 9% of the variation was accounted for by geographical region and 91% by lines. Both Structure and principal coordinate analyses indicated two subpopulations in the collection confirming separation of genotypes due to growth habit adaptation. Information on B. napus genotypes containing unique alleles is valuable for breeding programs in different parts of the world seeking to improve agronomic traits and adaptability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,337

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2013
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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