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Enregistrement W2040889492 · doi:10.1073/pnas.0907106106

Mitosomes in <i>Entamoeba histolytica</i> contain a sulfate activation pathway

2009· article· en· W2040889492 sur OpenAlexaff
Fumika Mi‐ichi, M. Yousuf, Kumiko Nakada‐Tsukui, Tomoyoshi Nozaki

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmoebic Infections and Treatments
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesRoyal Holloway, University of LondonMinistry of Health, Labour and WelfareMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyJapan Health Sciences Foundation
Mots-clésEntamoeba histolyticaBiologyBiochemistryOrganelleInorganic pyrophosphataseSulfateEntamoebaMitochondrionWestern blotMicrobiologyEnzymeChemistryGenePyrophosphate

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hydrogenosomes and mitosomes are mitochondrion-related organelles in anaerobic/microaerophilic eukaryotes with highly reduced and divergent functions. The full diversity of their content and function, however, has not been fully determined. To understand the central role of mitosomes in Entamoeba histolytica, a parasitic protozoon that causes amoebic dysentery and liver abscesses, we examined the proteomic profile of purified mitosomes. Using 2 discontinuous Percoll gradient centrifugation and MS analysis, we identified 95 putative mitosomal proteins. Immunofluorescence assay showed that 3 proteins involved in sulfate activation, ATP sulfurylase, APS kinase, and inorganic pyrophosphatase, as well as sodium/sulfate symporter, involved in sulfate uptake, were compartmentalized to mitosomes. We have also provided biochemical evidence that activated sulfate derivatives, adenosine-5'-phosphosulfate and 3'-phosphoadenosine-5'-phosphosulfate, were produced in mitosomes. Phylogenetic analysis showed that the aforementioned proteins and chaperones have distinct origins, suggesting the mosaic character of mitosomes in E. histolytica consisting of proteins derived from alpha-proteobacterial, delta-proteobacterial, and ancestral eukaryotic origins. These results suggest that sulfate activation is the major function of mitosomes in E. histolytica and that E. histolytica mitosomes represent a unique mitochondrion-related organelle with remarkable diversity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,432
Score d'incertitude au seuil0,176

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations148
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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