Bacterial Community and “ <i>Candidatus</i> Accumulibacter” Population Dynamics in Laboratory-Scale Enhanced Biological Phosphorus Removal Reactors
Notice bibliographique
Résumé
"Candidatus Accumulibacter" and total bacterial community dynamics were studied in two lab-scale enhanced biological phosphorus removal (EBPR) reactors by using a community fingerprint technique, automated ribosomal intergenic spacer analysis (ARISA). We first evaluated the quantitative capability of ARISA compared to quantitative real-time PCR (qPCR). ARISA and qPCR provided comparable relative quantification of the two dominant "Ca. Accumulibacter" clades (IA and IIA) detected in our reactors. The quantification of total "Ca. Accumulibacter" 16S rRNA genes relative to that from the total bacterial community was highly correlated, with ARISA systematically underestimating "Ca. Accumulibacter" abundance, probably due to the different normalization techniques applied. During 6 months of normal (undisturbed) operation, the distribution of the two clades within the total "Ca. Accumulibacter" population was quite stable in one reactor while comparatively dynamic in the other reactor. However, the variance in the clade distribution did not appear to affect reactor performance. Instead, good EBPR activity was positively associated with the abundance of total "Ca. Accumulibacter." Therefore, we concluded that the different clades in the system provided functional redundancy. We disturbed the reactor operation by adding nitrate together with acetate feeding in the anaerobic phase to reach initial reactor concentrations of 10 mg/liter NO(3)-N for 35 days. The reactor performance deteriorated with a concomitant decrease in the total "Ca. Accumulibacter" population, suggesting that a population shift was the cause of performance upset after a long exposure to nitrate in the anaerobic phase.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».