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Enregistrement W2041021719 · doi:10.1089/jir.2012.0052

HIV Downregulates Interferon-Stimulated Genes in Primary Macrophages

2012· article· en· W2041021719 sur OpenAlex
Seong‐Heon Wie, Pinyi Du, Tiffany Luong, Steffney E. Rought, Nadejda Beliakova‐Bethell, Jean Lozach, Jacques Corbeil, Richard S. Kornbluth, Douglas D. Richman, Christopher H. Woelk

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Interferon & Cytokine Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCenter for AIDS Research, University of WashingtonUniversity of California, San DiegoNational Institutes of HealthOffice of Research and DevelopmentU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésISG15Downregulation and upregulationInnate immune systemInterferonBiologyTranscriptomeInterferon-stimulated geneImmune systemGeneVirusVirologyInterferon type IReverse transcriptaseImmunologyGene expressionPolymerase chain reactionGeneticsUbiquitin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HIV is able to outpace the innate immune response, including that mediated by interferon (IFN), to establish a productive infection. Primary macrophages, however, may be protected from HIV infection by treatment with type I IFN before virus exposure. The ability of HIV to modulate the type I IFN-mediated innate immune response when it encounters a cell that has already been exposed to IFN remains poorly defined. The optimal pretreatment time (12 h) and the most potent HIV-inhibitors (e.g., IFN-α2 and -ω) were identified to investigate the ability of HIV to modulate an established type I IFN response. Gene expression at the level of the entire transcriptome was then compared between primary macrophages treated with type I IFNs, as opposed to treated with IFNs and then infected with HIV. Although HIV was not able to establish a robust infection, the virus was able to downregulate a number of IFN-stimulated genes (ISGs) with a fold change greater than 1.5 (i.e., AXL, IFI27, IFI44, IFI44L, ISG15, OAS1, OAS3, and XAF1). The downregulation of OAS1 by the presence of HIV was confirmed by real-time quantitative polymerase chain reaction. In conclusion, even though HIV replication is significantly inhibited by IFN pretreatment, the virus is able to downregulate the transcription of known antiviral ISGs (e.g., IFI44, ISG15, and OAS1).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,056
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle