HIV Downregulates Interferon-Stimulated Genes in Primary Macrophages
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Notice bibliographique
Résumé
HIV is able to outpace the innate immune response, including that mediated by interferon (IFN), to establish a productive infection. Primary macrophages, however, may be protected from HIV infection by treatment with type I IFN before virus exposure. The ability of HIV to modulate the type I IFN-mediated innate immune response when it encounters a cell that has already been exposed to IFN remains poorly defined. The optimal pretreatment time (12 h) and the most potent HIV-inhibitors (e.g., IFN-α2 and -ω) were identified to investigate the ability of HIV to modulate an established type I IFN response. Gene expression at the level of the entire transcriptome was then compared between primary macrophages treated with type I IFNs, as opposed to treated with IFNs and then infected with HIV. Although HIV was not able to establish a robust infection, the virus was able to downregulate a number of IFN-stimulated genes (ISGs) with a fold change greater than 1.5 (i.e., AXL, IFI27, IFI44, IFI44L, ISG15, OAS1, OAS3, and XAF1). The downregulation of OAS1 by the presence of HIV was confirmed by real-time quantitative polymerase chain reaction. In conclusion, even though HIV replication is significantly inhibited by IFN pretreatment, the virus is able to downregulate the transcription of known antiviral ISGs (e.g., IFI44, ISG15, and OAS1).
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle