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Enregistrement W2041064967 · doi:10.1186/1753-6561-5-s8-p132

About making a CHO production cell line “research-friendly” by genetic engineering

2011· article· en· W2041064967 sur OpenAlexaboutno aff
Bernd Voedisch, Agnès Patoux, Jildou Sterkenburgh, Mirjam Buchs, Emily Barry, Cyril Allard, Sabine Geisse

Notice bibliographique

RevueBMC Proceedings · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueViral Infectious Diseases and Gene Expression in Insects
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineProduction (economics)Line (geometry)BiotechnologyBioinformaticsComputational biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The use of Chinese Hamster Ovary (CHO) cells for transient gene expression is gaining importance steadily, as it has been shown that both quality and quantity of proteins derived from CHO cells differs from and can even be superior to material derived from Human Embryonic Kidney (HEK293) cells [1][2][3][4].In order to augment yields HEK cell lines have been genetically modified, by e.g.stable integration of an expression cassette coding for the Epstein-Barr Virus Nuclear Antigen 1 (EBNA1) in conjunction with expression plasmid vectors containing the EBNA1 interaction site oriP.Here we describe the generation of a CHO cell line stably expressing the EBNA1 gene to enhance yields after large scale transient transfection with polyethylenimine (PEI).An expression plasmid featuring the EBNA1 gene was transfected into an in-house available CHO wild type cell line by nucleofection and several stable pools were established by antibiotic selection.In a first approach, 133 clones were then isolated by limiting dilution cloning and subsequently expanded for further analysis.The approach aimed at identifying clones showing both the presence of EBNA1 protein and enhanced yields after PEI-mediated transient expression of a reporter protein at the same time.Cell lysates or nuclear and cytoplasmic protein extracts from these clones were tested for presence of EBNA1 protein by Western Blot.An in-licensed cell line, CHO EBNALT85 (Icosagen AS, Tartu, Estonia) expressing the full length EBNA1 gene, and the HEK293-6E cell line (from the group of Y. Durocher, NRC, Canada) expressing a truncated EBNA1 gene served as positive controls.A number of commercially available anti-EBNA1 antibodies were tested in Western blotting, but most antibodies failed to detect the EBNA1 protein produced by these positive control cells.Only

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,692

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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