Expression of RBM5‐related factors in primary breast tissue
Notice bibliographique
Résumé
The aim of this study was to examine the expression of the RBM5 tumor suppressor, in relation to RBM6 and RBM10, to obtain a better understanding of the potential role played by these RBM5-related factors in the regulation of RBM5 tumor-suppressor activity. Paired non-tumor and tumor samples were obtained from 73 breast cancer patients. RNA and protein expression were examined by semi-quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction and immunoblot, respectively. Data were analyzed using various statistical methods to test for correlations amongst the RBM5-related factors, and between the factors and various pathological parameters. Most notably, RBM5, RBM10v1, and HER2 protein expression levels were elevated in tumor tissue (P < 0.0001). RBM5 and RBM10v1 protein expression were significantly positively correlated (P < 0.001), as were RBM5 and HER2 protein expression (P < 0.01), in both non-tumor and tumor tissue, whereas RBM10v1 and HER2 protein expression were only marginally correlated, in non-tumor tissue (P < 0.05). Interestingly, RBM5 and RBM10v1 protein expression were both deregulated in relation to RNA expression in tumor tissue. RBM10v2 and RBM6 RNA were highly significantly positively correlated in relation to various factors relating to poor prognosis (P < 0.0001). To our knowledge, this study is the first to examine RBM5 expression at both the RNA and protein level in primary breast tumor tissue, and the first to examine expression of all RBM5-related factors in a comprehensive manner. The results provide a graphic illustration that RBM5-related factors are significantly differentially expressed in breast cancer, and suggest complex inter-related regulatory networks involving alternative splicing, oncogenic expression, and tissue-specific function.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».