Unique translation initiation of mRNAs-containing TISU element
Notice bibliographique
Résumé
Translation Initiator of Short 5' UTR (TISU) is a unique regulatory element of both transcription and translation initiation. It is present in a sizable number of genes with basic cellular functions and a very short untranslated region (5' UTR). Here, we investigated translation initiation from short 5' UTR mRNAs with AUG in various contexts. Reducing 5' UTR length to the minimal functional size increases leaky scanning from weak and strong initiators but hardly affects translation initiation and ribosomal binding directed by TISU. Ribosome interaction with TISU mRNA is cap dependent and involves AUG downstream nucleotides that compensate for the absent 5' UTR contacts. Interestingly, eIF1 inhibits cap-proximal AUG selection within weak or strong contexts but not within TISU. Furthermore, TISU-directed translation is unaffected by inhibition of the RNA helicase eIF4A. Thus, TISU directs efficient cap-dependent translation initiation without scanning, a mechanism that would be advantageous when intracellular levels of eIF1 and eIF4A fluctuate.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».