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Enregistrement W2041295749 · doi:10.1289/ehp.0901031

Global Gene Expression Analysis in the Livers of Rat Offspring Perinatally Exposed to Low Doses of 2,2′,4,4′-Tetrabromodiphenyl Ether

2009· article· en· W2041295749 sur OpenAlexafffund
Alexander Suvorov, Larissa Takser

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Health Perspectives · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueToxic Organic Pollutants Impact
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAryl hydrocarbon receptorMetabolic pathwayOffspringLipid metabolismBiologyBiological pathwayDevelopmental toxicityMetabolismGene expressionDrug metabolismPeroxisomeBiochemistryPeroxisome proliferator-activated receptorReceptorGeneGeneticsTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Polybrominated diphenyl ethers are a group of flame-retardant chemicals appearing increasingly in the environment. Their health effects and mechanisms of toxicity are poorly understood. OBJECTIVES: We screened for the sensitive effects and mechanisms of toxicity of 2,2 ,4,4 -tetra-bromodiphenyl ether (BDE-47) by analyzing the gene expression profile in rats exposed to doses comparable to human exposure. METHODS: Wistar dams were exposed to vehicle or BDE-47 (0.002 and 0.2 mg/kg body weight) every fifth day from gestation day 15 to postnatal day 20 by injections to caudal vein. Total RNA was extracted from the livers of pups and hybridized to the whole-genome RNA expression micro-arrays. The list of genes 2-fold differentially expressed was exported to PANTHER and Ingenuity Systems for analysis of enriched ontology groups and molecular pathways. RESULTS: Oxidoreductase and transferase protein families were enriched in exposed rats as were these biological process categories: carbohydrate metabolism; electron transport; and lipid, fatty acid, and steroid metabolism. Four signaling pathways (cascades of activation of drug-metabolizing enzymes) and 10 metabolic pathways were significantly enriched. Drug-metabolizing enzymes appear to be regulated by BDE-47 through an aryl hydrocarbon receptor-independent mechanism. Direct interaction with retinoid X receptor or its upstream cascade may be involved. The main metabolic effects consisted of activation of metabolic pathways: alpha- and omega-oxidation of fatty acids, glycolysis, and starch hydrolysis. CONCLUSIONS: Altered expression of genes involved in metabolic and signaling pathways and functions of the organism occurs after perinatal exposure of rat offspring to BDE-47 at doses relevant for the general population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,831
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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