Mutational analysis of tumor suppressor gene p53 in feline vaccine site-associated sarcomas
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: To investigate the role of tumor suppressor gene p53 mutation in feline vaccine site-associated sarcoma (VSS) development and to evaluate the relationship between p53 nucleotide sequence and protein expression. SAMPLE POPULATION: Formalin-fixed paraffin-embedded tissues of 8 feline VSS with dark p53 immunostaining (high p53 expression) and 13 feline VSS with faint or no staining (normal p53 expression). PROCEDURE: DNA was extracted from neoplastic and normal tissue from each paraffin block. The following 3 regions of the p53 gene were amplified by polymerase chain reaction: 379 base pair (bp) region of exon 5, intron 5, and exon 6, 108 bp region of exon 7, and 140 bp region of exon 8. Amplified p53 products were sequenced and compared with published feline p53. The p53 mutations identified were correlated with p53 mutations predicted by immunostaining. RESULTS: Neoplastic cells of 5 of 8 (62.5%) VSS that had high p53 expression harbored single missense mutations within the p53 gene regions examined. The p53 gene mutations were not detected in the 13 tumors with normal p53 immunostaining. Nonneoplastic tissues adjacent to all 21 VSS lacked mutations of these p53 gene regions. CONCLUSIONS: The p53 gene mutations were restricted to neoplastic tissue and, therefore, were unlikely to predispose to VSS. However, p53 mutations may have contributed to cancer progression in 5 of the 21 VSS. There was very good (kappa quotient = 0.67 with a confidence limit of 0.3 to 1.0), although not complete, agreement between prediction of mutation by p53 immunostaining and identification of mutations by sequencing of key p53 gene regions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».