PCL2 modulates gene regulatory networks controlling self-renewal and commitment in embryonic stem cells
Notice bibliographique
Résumé
Recent reports have better elucidated the components of the Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2) and its functional role in embryonic stem cells (ESCs) and their differentiated derivatives. The depletion of a newly described mammalian PRC2 associated protein, PCL2, leads to an increase in ESC self-renewal and a delay in differentiation, a phenotype similar to knockouts of the core PRC2 members. Genomic and cell biology data suggest that PCL2 is important in cell fate decisions and may play a role in recruitment of PRC2 to target genes and histone methylation. Importantly, depletion of PCL2 in ESCs leads to a decrease in 3meH3K27 at the proximal promoter regions of pluripotency transcription factors Tbx3, Klf4, Foxd3 and a concomitant increase in gene expression. These proteins subsequently activate expression of Oct4, Nanog and Sox2 through a feed-forward gene regulatory circuit, altering the core pluripotency network and driving cell fate decisions towards self-renewal. We propose a model whereby alteration of the epigenetic state of Tbx3, Klf4, and Foxd3 results in the enforced expression of the pluripotency network, preventing differentiation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».