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Enregistrement W2041473955 · doi:10.1080/10937404.2010.483176

Toxicity Testing in the 21st Century: A Vision and a Strategy

2010· article· en· W2041473955 sur OpenAlexaff
Daniel Krewski, Daniel Acosta, Melvin E. Andersen, Henry A. Anderson, John C. Bailar, Kim Boekelheide, Robert J. Brent, Gail Charnley, Vivian G. Cheung, Sídney Green, Karl T. Kelsey, Nancy I. Kerkvliet, Abby A. Li, Lawrence McCray, Otto Meyer, Reid D. Patterson, William D. Pennie, Robert A. Scala, Gina Solomon, Martin L. Stephens, James D. Yager, Lauren Zeise, Staff of Committee on Toxicity Test

Notice bibliographique

RevueJournal of Toxicology and Environmental Health Part B · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEffects and risks of endocrine disrupting chemicals
Établissements canadiensInstitute of Population and Public HealthUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health Sciences
Mots-clésTest strategyToxicityComputer scienceRelevance (law)Risk assessmentRisk analysis (engineering)BiologyComputational biologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

With the release of the landmark report Toxicity Testing in the 21st Century: A Vision and a Strategy, the U.S. National Academy of Sciences, in 2007, precipitated a major change in the way toxicity testing is conducted. It envisions increased efficiency in toxicity testing and decreased animal usage by transitioning from current expensive and lengthy in vivo testing with qualitative endpoints to in vitro toxicity pathway assays on human cells or cell lines using robotic high-throughput screening with mechanistic quantitative parameters. Risk assessment in the exposed human population would focus on avoiding significant perturbations in these toxicity pathways. Computational systems biology models would be implemented to determine the dose-response models of perturbations of pathway function. Extrapolation of in vitro results to in vivo human blood and tissue concentrations would be based on pharmacokinetic models for the given exposure condition. This practice would enhance human relevance of test results, and would cover several test agents, compared to traditional toxicological testing strategies. As all the tools that are necessary to implement the vision are currently available or in an advanced stage of development, the key prerequisites to achieving this paradigm shift are a commitment to change in the scientific community, which could be facilitated by a broad discussion of the vision, and obtaining necessary resources to enhance current knowledge of pathway perturbations and pathway assays in humans and to implement computational systems biology models. Implementation of these strategies would result in a new toxicity testing paradigm firmly based on human biology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,101
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,037
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,101
Score d'incertitude au seuil0,532

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1010,037
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0060,003
Études des sciences et des technologies0,0040,033
Communication savante0,0190,037
Science ouverte0,0070,020
Intégrité de la recherche0,0230,032
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,328 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 678
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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