Identification and characterization of missense alterations in the BRCA1 associated RING domain (<i>BARD1</i>) gene in breast and ovarian cancer
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: BRCA1 associated RING domain protein (BARD1) was originally identified due to its interaction with the RING domain of BRCA1. BARD1 is required for S phase progression, contact inhibition and normal nuclear division, as well as for BRCA1 independent, p53 dependent apoptosis. METHODS: To investigate whether alterations in BARD1 are involved in human breast and ovarian cancer, we used single strand conformation polymorphism analysis and sequencing on 35 breast tumours and cancer cell lines and on 21 ovarian tumours. RESULTS: Along with the G2355C (S761N) missense mutation previously identified in a uterine cancer, we found two other variants in breast cancers, T2006C (C645R) and A2286G (I738V). The T2006C (C645R) mutation was also found in one ovarian tumour. A variant of uncertain consequence, G1743C (C557S), was found to be homozygous or hemizygous in an ovarian tumour. Eleven variants of BARD1 were characterised with respect to known functions of BARD1. None of the variants appears to affect localisation or interaction with BRCA1; however, putative disease associated alleles appear to affect the stability of p53. These same mutations also appear to abrogate the growth suppressive and apoptotic activities of BARD1. CONCLUSIONS: These activities allowed us to identify one of the rare variants (A2286G; I738V) as a neutral polymorphism rather than a detrimental mutation, and suggested that G1743C (C557S) is not a polymorphism but may contribute to the cancer phenotype.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».