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Enregistrement W2041527928 · doi:10.1107/s0907444901005212

Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of glycerol 3-phosphate cytidylyltransferase from<i>Staphylococcus aureus</i>

2001· article· en· W2041527928 sur OpenAlexaff
V. Yim, Michela Zolli, David S. Badurina, Laura Rossi, Eric D. Brown, Albert M. Berghuis

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section D Biological Crystallography · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueEnzyme Structure and Function
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCrystallizationStaphylococcus aureusGlycerolEscherichia coliCrystallographyMoleculeChemistryDiffractionMaterials scienceBiochemistryOpticsBiologyBacteriaPhysicsOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glycerol 3-phosphate cytidylyltransferase from Staphylococcus aureus (TarD(Sa)) has been expressed in Escherichia coli, purified to homogeneity and crystallized. The strategy used for determining crystallization conditions employed hanging-drop sparse-matrix screens and required a combination of three different optimization approaches. Specifically, the presence or absence of cofactors needed to be surveyed, the effects of small-molecule additives required exploration and the rate of vapour-diffusion had to be varied in order to obtain crystals of TarD(Sa) suitable for diffraction studies. Crystals thus obtained belong to the space group P3(1)21, with unit-cell parameters a = b = 92.2, c = 156.1 A, and contain four TarD(Sa) molecules per asymmetric unit. The resolution limit observed for these crystals using synchrotron radiation is 3.0 A.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,925
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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