MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2041568775 · doi:10.1186/1471-2350-14-5

Contribution of the PALB2 c.2323C>T [p.Q775X] Founder mutation in well-defined breast and/or ovarian cancer families and unselected ovarian cancer cases of French Canadian descent

2013· article· en· W2041568775 sur OpenAlexafffundabout
Marc Derek Tischkowitz, Nelly Sabbaghian, Nancy Hamel, Carly Pouchet, William D. Foulkes, Anne‐Marie Mes‐Masson, Diane Provencher, Patricia N. Tonin

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Genetics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill University Health CentreJewish General HospitalCentre Hospitalier de l’Université de MontréalMcGill University
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéUniversité de MontréalJewish General HospitalCancer Research SocietyMcGill University Health CentreCanadian Breast Cancer Research AllianceMinistero dello Sviluppo EconomicoMcGill University
Mots-clésOvarian cancerPALB2Breast cancerOncologyPopulationCancerBRCA mutationInternal medicineMedicineSerous fluidFounder effectGynecologyGermline mutationMutationBiologyGeneticsGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The PALB2 c.2323C>T [p.Q775X] mutation has been reported in at least three breast cancer families and breast cancer cases of French Canadian descent and this has been attributed to common ancestors. The number of mutation-positive cases reported varied based on criteria of ascertainment of index cases tested. Although inherited PALB2 mutations are associated with increased risks of developing breast cancer, risk to ovarian cancer has not been fully explored in this demographically unique population. METHODS: We screened the PALB2 p.Q775X variant in 71 families with at least three cases of breast cancer (n=48) or breast and ovarian cancers (n=23) that have previously been found negative for at least the most common BRCA1 and BRCA2 mutations reported in the French Canadian population and in 491 women of French Canadian descent who had invasive ovarian cancer and/or low malignant potential tumors of the major histopathological subtypes. RESULTS: We identified a PALB2 p.Q775X carrier in a breast cancer family, who had invasive ductal breast carcinomas at 39 and 42 years of age. We also identified a PALB2 p.Q775X carrier who had papillary serous ovarian cystadenocarcinoma at age 58 among the 238 serous subtype ovarian cancer cases investigated, who also had breast cancer at age 52. CONCLUSION: Our findings, taken together with previous reports, support adding PALB2 c.2323C>T p.Q775X to the list of cancer susceptibility genes for which founder mutations have been identified in the French Canadian population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,350
Score d'incertitude au seuil0,704

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2013
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBMC Medical GeneticsMême sujetBRCA gene mutations in cancerTravaux en français237 207