Adhesion mechanism in a DOPA-deficient foot protein from green mussels
Notice bibliographique
Résumé
The holdfast or byssus of Asian green mussels, Perna viridis, contains a foot protein, pvfp-1, that differs in two respects from all other known adhesive mussel foot proteins (mfp): (1) instead of the hallmark L-3,4-dihydroxyphenylalanine (DOPA) residues in mfp-1, for example, pvfp-1 contains C(2)-mannosyl-7-hydroxytryptophan (Man7OHTrp). (2) In addition, pvfp-1 chains are not monomeric like mfp-1 but trimerized by collagen and coiled-coil domains near the carboxy terminus after a typical domain of tandemly repeated decapeptides. Here, the contribution of these peculiarities to adhesion was examined using a surface forces apparatus (SFA). Unlike previously studied mfp-1s, pvfp-1 showed significant adhesion to mica and, in symmetric pvfp-1 films, substantial cohesive interactions were present at pH 5.5. The role of Man7OHTrp in adhesion is not clear, and a DOPA-like role for Man7OHTrp in metal complexation (e.g., Cu(2+), Fe(3+)) was not observed. Instead, cation-π interactions with low desolvation penalty between Man7OHTrp and lysyl side chains and conformational changes (raveling and unraveling of collagen helix and coiled-coil domains) are the best explanations for the strong adhesion between pvfp-1 monomolecular films. The strong adhesion mechanism induced by cation-π interactions and conformational changes in pvfp-1 provides new insights for the development of biomimetic underwater adhesives.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».