Specificity and binding kinetics of murine lupus anti‐DNA monoclonal antibodies implicate different stimuli for their production
Notice bibliographique
Résumé
The origin and relative biological importance of the many different DNA-reactive antibodies that appear in systemic lupus erythematosus are not well understood. A detailed analysis of their fine specificity and binding characteristics with DNA is a necessary step in understanding their biology. We have examined here two monoclonal antibodies (mAb) IV-228 and V-88 that are, respectively, characteristic of antibodies, which bind exclusively to single-stranded (ss) DNA and to both double-stranded (ds) DNA and ssDNA. By surface plasmon resonance (SPR) on BIAcore, we characterized the kinetics of binding of each antibody to synthetic ss and ds oligonucleotides. Antibody V-88 and IV-228 showed different patterns of reactivity for both ss and ds oligonucleotides, characterized by distinctly different kinetic parameters. Analysis of their binding kinetics indicates the importance of base composition in defining DNA epitopes, and shows that some epitopes, such as that recognized by mAb V-88, are expressed on dsDNA and ssDNA, whereas others, as recognized by IV-228, are not. The base preferences of V-88 for ds GC-rich structures over AT-rich, and of IV-228 for ss T-rich structures, also reveal distinct differences between these antibodies. We conclude that the different binding properties of the antibodies will relate to their biological activities. The base preferences of the antibodies suggest that they might be induced by different immunological stimuli, such as those that could be provided by the various DNA fragments and structures released during programmed cell death.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».