MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2041905284 · doi:10.1074/jbc.m201256200

In the First Extracellular Domain of E-cadherin, Heterophilic Interactions, but Not the Conserved His-Ala-Val Motif, Are Required for Adhesion

2002· article· en· W2041905284 sur OpenAlexafffund
Margaret Renaud‐Young, Warren J. Gallin

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchDirectorate for Biological Sciences
Mots-clésCadherinCell adhesionMutantExtracellularConserved sequenceCell biologySequence motifBiologyCell adhesion moleculePeptide sequenceCellBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The classical cadherins, definitive proteins of the cadherin superfamily, are characterized functionally by their ability to mediate calcium-dependent cell aggregation in vitro. To test hypothetical mechanisms of adhesion, we have constructed two mutants of the chicken E-cadherin protein, one with the highly conserved His-Ala-Val (HAV) sequence motif reversed to Val-Ala-His (VAH), the other lacking the first extracellular domain (EC1). The inversion of HAV to VAH has no effect on the capacity of E-cadherin to mediate adhesion. Deletion of EC1 completely eliminates the ability of E-cadherin to mediate homophilic adhesion, but the deletion mutant is capable of adhering heterophilically to both unmutated E-cadherin and to the HAV/VAH mutant. These results demonstrate that the conserved HAV sequence motif is not involved in cadherin-mediated adhesion as has been suggested previously and supports the idea that in the context of the cell surface, cadherin-mediated cell-cell adhesion involves an interaction of EC1 with other domains of the cadherin extracellular moiety and not the "linear zipper" model, which posits trans interactions only between EC1 on apposing cell surfaces.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetWnt/β-catenin signaling in development and cancerTravaux en français237 207