Distinct regulation of Ubc13 functions by the two ubiquitin-conjugating enzyme variants Mms2 and Uev1A
Notice bibliographique
Résumé
Ubc13, a ubiquitin-conjugating enzyme (Ubc), requires the presence of a Ubc variant (Uev) for polyubiquitination. Uevs, although resembling Ubc in sequence and structure, lack the active site cysteine residue and are catalytically inactive. The yeast Uev (Mms2) incites noncanonical Lys63-linked polyubiquitination by Ubc13, whereas the increased diversity of Uevs in higher eukaryotes suggests an unexpected complication in ubiquitination. In this study, we demonstrate that divergent activities of mammalian Ubc13 rely on its pairing with either of two Uevs, Uev1A or Mms2. Structurally, we demonstrate that Mms2 and Uev1A differentially modulate the length of Ubc13-mediated Lys63-linked polyubiquitin chains. Functionally, we describe that Ubc13-Mms2 is required for DNA damage repair but not nuclear factor kappaB (NF-kappaB) activation, whereas Ubc13-Uev1A is involved in NF-kappaB activation but not DNA repair. Our finding suggests a novel regulatory mechanism in which different Uevs direct Ubcs to diverse cellular processes through physical interaction and alternative polyubiquitination.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».