MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2042100538 · doi:10.1074/jbc.m308936200

Thermodynamics of Oxidation-Reduction Reactions in Mammalian Nitric-oxide Synthase Isoforms

2004· article· en· W2042100538 sur OpenAlexaff
Ying Gao, Susan M. Smith, Jason B. Weinberg, Heather J. Montgomery, E.M. Newman, J. Guy Guillemette, Dipak Ghosh, Linda J. Roman, Pavel Martásek, John C. Salerno

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNitric Oxide and Endothelin Effects
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésFlavin groupChemistryNitric oxideNitric oxide synthaseCofactorCalmodulinRedoxFlavin mononucleotideFlavoproteinFlavin adenine dinucleotideEndothelial NOSReductaseGene isoformTetrahydrobiopterinNitric Oxide Synthase Type IIIStereochemistryBiochemistryEnosEnzymeInorganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The three mammalian nitric-oxide synthases produce NO from arginine in a reaction requiring 3 electrons per NO, which are supplied to the catalytic center from NADPH through reductase domains incorporating FAD and FMN cofactors. The isoforms share a common reaction mechanism and requirements for reducing equivalents but differ in regulation; the endothelial and neuronal isoforms are controlled by calcium/calmodulin modulation of the electron transfer system, while the inducible isoform binds calmodulin at all physiological Ca(2+) concentrations and is always on. The thermodynamics of electron transfer through the flavin domains in all three isoforms are basically similar. The major flavin states are FMN, FMNH., FMNH(2), FAD, FADH., and FADH(2). The FMN/FMNH. couple is high potential ( approximately 100 mV) in all three isoforms and is unlikely to be catalytically competent; the other three flavin couples form a nearly isopotential group clustered around -250 mV. Reduction of the flavins by the pyridine nucleotide couple at -325 mV is thus moderately thermodynamically favorable. The ferri/ferroheme couple in all three isoforms is approximately -270 mV in the presence of saturating arginine. Ca(2+)/calmodulin has no effect on the potentials of any of the couples in endothelial nitric-oxide synthase (eNOS) or neuronal nitric-oxide synthase (nNOS). The pH dependence of the flavin couples suggests the presence of ionizable groups coupled to the flavin redox/protonation states.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetNitric Oxide and Endothelin EffectsTravaux en français237 207