Synthesis of Ligand-Specific Phage-Display ScFv against the Herbicide Picloram by Direct Cloning from Hyperimmunized Mouse
Notice bibliographique
Résumé
Immunoglobulin genes were directly isolated from the splenocytes of a BALB/C mouse hyperimmunized with the auxinic herbicide picloram conjugated to bovine serum albumin. Variable light and heavy domain DNA were joined to produce single-chain Fv (scFv) DNA, which was cloned into phage vector fd-tet-GIIID to display multiple copies of scFv on the filamentous phage minor coat protein gIIIp. The phage-display scFv library (10(4) clones) was selected against picloram conjugated to ovalbumin. After five rounds of panning, individual clones were analyzed. ScFv with different affinities to picloram (IC(50) values ranging from 20 ppb to 10 ppm) were detected in the final enriched pool. The increased avidity of the phage vector enhanced the selection (i.e., panning) of multiple picloram-specific recombinant antibodies. Stringent selection was required to isolate the clones with the highest affinity. Nucleotide sequence analysis of six isolated clones revealed that all of the V(L) belonged to the V kappa 9A family joined to J kappa 2 segments. All of the V(H) belonged to the V(H)()7183 family and joined to two different J segments (i.e., J(H)()2 or J(H)()4). Different from the immune response to large molecular weight molecules (MW > 10,000 Da), which requires both VDJ segment rearrangement and somatic hypermutations, production of high-affinity antibodies to picloram, a small ligand having a formula weight of 241.5 Da, predominantly requires somatic hypermutations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».