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Enregistrement W2042259764 · doi:10.1038/ng0604-543

A public gene trap resource for mouse functional genomics

2004· letter· en· W2042259764 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueNature Genetics · 2004
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesUniversity of TorontoWellcome Trust
Mots-clésBiologyGenBankGenomeGeneGeneticsFunctional genomicsGenomic libraryGenomicsComputational biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gene trapping is a high-throughput approach that can be used to introduce insertional mutations across the genome in mouse embryonic stem (ES) cells. Gene trap vectors simultaneously mutate and report the expression of the endogenous gene at the site of insertion and provide a DNA tag for the rapid identification of the disrupted gene. The generation of mutant mice from a large collection of ES cell lines carrying gene trap insertions could be applied to large-scale functional analysis of the 30,000 mammalian genes. The overall impact of gene trap resources will rest on the fraction of the genome that is accessible with this technology, the efficiency relative to other competing technologies and the availability of such a resource to the academic community. Lexicon Genetics, a US-based biotechnology company, was the first to implement a genome-wide gene trapping program 1 and has developed OmniBank (http://www.lexicongenetics.com), the largest library of mutant ES cell lines. A parallel effort was initiated in the public domain by several academic groups in the International Gene Trap Consortium (IGTC; http://www.igtc.ca). The recent release of OmniBank sequence tags to GenBank 2 has made it possible to compare the size and efficiency of the existing gene trap libraries.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,383
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0040,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle