Plasminogen binds to plasmin-modulated factor Xa by Ca2+- and C-terminal lysine-dependent and -independent interactions
Notice bibliographique
Résumé
Plasminogen binding to receptors involves both C-terminal lysine- dependent and -independent interactions. The latter are poorly understood. Our earlier work demonstrated a novel Ca (2+) -enhanced bivalent interaction between plasmin-cleaved FXa (FXa33/13) and plasminogen truncated at Lys78 (Lys-Pg). Here we hypothesized that the effects of Ca (2+) may enable dissection of the C-terminal lysine-dependent and -independent interactions. To evaluate the role of the Glu-plasminogen (Glu-Pg) amino acids 1 - 77, binding of FXa33/13 to immobilized Glu-Pg was compared to Lys-Pg by surface plasmon resonance. Under identical conditions, approximately half the amount of FXa33/13 bound to Glu-Pg. The simplest fit of data suggested a 2:1 plasminogen:FXa33/13 stoichiometry for both, which were proportionately enhanced by Ca (2+) . Only Lys-Pg demonstrated significant Ca (2+) -independent binding to FXa33/13. In the presence of Ca (2+) , weak C-terminal lysine-independent binding could be detected, but only for Glu-Pg. The elastase-generated plasminogen fragment encompassing the angiostatin-like kringle domains 1 to 3 (K1 - 3) inhibited binding of FXa33/13 to Lys-Pg, whereas fragments corresponding to kringle 4- and kringle 5-protease domain had no effect. Immobilized K1 - 3 binding to FXa33/13 had both Ca (2+) -dependent and -independent components. The principal K (d) for the interaction was 10-fold higher than Lys-Pg. In the presence of Ca (2+) , eACA inhibited FXa33/13 binding to K1 - 3 by 30%, but eliminated binding in the absence of Ca (2+) . These studies suggest that Ca (2+) -dependent and -independent binding of Lys-Pg to FXa33/13 are C-terminal lysine-dependent. The N-terminal 1 - 77 amino acids of Glu-Pg confer significant C-terminal lysine-independent binding, which may play a role during the initiating stages of plasminogen activation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».