Streptococcus suis serotyping by a new multiplex PCR
Notice bibliographique
Résumé
A multiplex PCR was developed to detect all true serotypes of Streptococcus suis. This multiplex PCR was composed of four reaction sets. The first set identified nine serotypes (serotypes 1/2, 1, 2, 3, 7, 9, 11, 14 and 16), the second set identified eight serotypes (serotypes 4, 5, 8, 12, 18, 19, 24 and 25), the third set identified seven serotypes (serotypes 6, 10, 13, 15, 17, 23 and 31), and the last set identified five serotypes (serotypes 21, 27, 28, 29 and 30). This assay correctly detected serotypes 2, 5, 14 and 24 in human isolates, and serotypes 1, 2, 1/2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 11, 12, 14, 15, 16, 17, 19, 24, 28 and 31 in pig isolates from Thailand. No cross-reaction was observed with other bacterial species. Our multiplex PCR was able to simultaneously amplify a DNA mixture of reference Streptococcus suis serotypes. This assay should be useful for serotype surveillance of human and pig isolates of Streptococcus suis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».