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Enregistrement W2042482682 · doi:10.1128/jcm.41.11.4930-4940.2003

Association of Genomic O Island 122 of <i>Escherichia coli</i> EDL 933 with Verocytotoxin-Producing <i>Escherichia coli</i> Seropathotypes That Are Linked to Epidemic and/or Serious Disease

2003· article· en· W2042482682 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaBC Centre for Disease ControlMcMaster UniversityHealth Canada
Organismes subventionnairesHealth Canada
Mots-clésSerotypeVTECVerocytotoxinVirulenceOutbreakEscherichia coliMicrobiologyVirologyBiologyDiarrheaGeneGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The distribution of EDL 933 O island 122 (OI-122) was investigated in 70 strains of Verocytotoxin-producing Escherichia coli (VTEC) of multiple serotypes that were classified into five "seropathotypes" (A through E) based on the reported occurrence of serotypes in human disease, in outbreaks, and/or in the hemolytic-uremic syndrome (HUS). Seropathotype A comprised 10 serotype O157:H7 and 3 serotype O157:NM strains. Seropathotype B (associated with outbreaks and HUS but less commonly than serotype O157:H7) comprised three strains each of serotypes O26:H11, O103:H2, O111:NM, O121:H19, and O145:NM. Seropathotype C comprised four strains each of serotypes O91:H21 and O113:H21 and eight strains of other serotypes that have been associated with sporadic HUS but not typically with outbreaks. Seropathotype D comprised 14 strains of serotypes that have been associated with diarrhea but not with outbreaks or HUS, and seropathotype E comprised animal VTEC strains of serotypes not implicated in human disease. All strains were tested for four EDL 933 OI-122 virulence genes (Z4321, Z4326, Z4332, and Z4333) by PCR. Negative PCRs were confirmed by Southern hybridization. Overall, 28 (40%) strains contained OI-122 (positive for all four virulence genes), 27 (38.6%) contained an "incomplete" OI-122 (positive for one to three genes), and 15 (21.4%) strains did not contain OI-122. The seropathotype distribution of complete OI-122 was as follows: 100% for seropathotype A, 60% for B, 36% for C, 15% for D, and 0% for E. The differences in the frequency of OI-122 between seropathotypes A, B, and C (associated with HUS) and seropathotypes D and E (not associated with HUS) and between seropathotypes A and B (associated with epidemic disease) and seropathotypes C, D, and E (not associated with epidemic disease) were highly significant (P < 0.0001).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,590
Score d'incertitude au seuil0,859

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle