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Enregistrement W2042610645 · doi:10.1002/ijc.10372

Promiscuous expression of Epstein‐Barr virus genes in Burkitt's lymphoma from the central African country Malawi

2002· article· en· W2042610645 sur OpenAlexaff
Shao‐An Xue, Louise G. Labrecque, Qilong Lu, Siao Kate Ong, Irvin A. Lampert, Peter N. Kazembe, Elizabeth Molyneux, Robin Broadhead, Eric Borgstein, Beverly E. Griffin

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Cancer · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral-associated cancers and disorders
Établissements canadiensHôtel-Dieu de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyLytic cycleVirologyBZLF1GeneViral OncogenePopulationVirus latencyGene expressionViral loadVirusEpstein–Barr virusLymphomaCancer researchGeneticsViral replicationHerpesviridaeViral diseaseImmunologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Primary BL in Malawian children has a very high frequency association, approaching 100%, with the human herpesvirus EBV. A detailed study carried out on viral gene expression in these tumours, using both fresh material and methanol-fixed FNAs, showed, contrary to prediction, that most belong to a variant "class II" latency category, with lytic cycle-related genes also expressed. That is, in addition to EBNA1 expression, membrane proteins (LMP1/2A), immediate early (BZLF1) and early (IR2 and IR4) genes, a putative viral oncogene (BARF1), CST (BART) antisense transcripts and the viral bcl-2 homologue are expressed in a high proportion of the BLs. Most, but not all, express the small viral (EBER) RNAs. Two other significant observations were made: (i) in addition to expression of cellular cytokine (IL-10) transcripts in all tumours investigated, the normally silent viral IL-10 homologue was expressed in some tumours; (ii) whereas EBNA1 expression from its restricted Qp promoter was generally observed, the nonrestricted Cp/Wp promoter was also active in some tumours. Viral gene expression in the Malawian [endemic (e)] BLs appears to be more promiscuous than predicted from other studies, but expression accords with the cytopathologic picture of eBLs as a rapidly proliferating cell population accompanied by considerable necrosis, and a clinically diverse disease. A small-scale study of relapse Malawian BLs revealed a different picture of viral association, more akin to systemic BL than eBL, where EBV appears to be absent or present only at very low levels. The significance of these findings is considered.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,205
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations110
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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