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Enregistrement W2042680403 · doi:10.1139/b06-025

An assessment of genetic diversity in <i>Desmodium sumichrastii</i> (Fabaceae) of central Mexico

2006· article· en· W2042680403 sur OpenAlexvenueno aff
Brenda Y. Bedolla-García, Sabina I. Lara-Cabrera

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCoordinación de la Investigación CientíficaUniversidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo
Mots-clésUPGMADendrogramRAPDGenetic diversityBiologyGenetic variationDesmodiumPopulationBoraginaceaeGenusTribeGenetic variabilityGeographyZoologyEvolutionary biologyEcologyBotanyDemographyGeneticsGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The genus Desmodium contains ca. 450 species, distributed in Eastern Asia, Mexico, and Brazil, with 40 endemic species in Mexico, including Desmodium sumichrastii (Schinder) Standley. Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) variation was used to assess genetic variation within and among five populations of D. sumichrastii from west-central Mexico, constituting the first assessment in the tribe Desmodieae. Ninety percent of all bands were polymorphic for the 10 decamer RAPD primers used. Sixty-one percent of the variation was within populations, and 39% was among them. This pattern of higher variation within than among populations is unusual, but can be attributed to ethological characteristics of pollinators. The unweighted pair-group method with arithmetic averages (UPGMA) dendrogram based on Nei's genetic distances plots populations from Jalisco together, whereas populations from Aguililla in the neighboring state of Michoacan are separated and next to the San Miguel del Monte population (also in Michoacan). However, the dendrogram based on Dice's similarity coefficient calculated for all individuals separately groups the populations from Aguililla. We also found a significant correlation between genetic and geographic distances, which is in agreement with Dice's UPGMA dendrogram, where closer populations are more genetically similar. Interestingly the most diverse populations are located within a Biosphere Preserve, and the least diverse populations are located in heavily disturbed sites.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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