<b><i>VPS13D</i></b> Gene Variant Is Associated with Altered IL-6 Production and Mortality in Septic Shock
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
<b><i>Background:</i></b> Genetic variations contribute to septic shock mortality. To discover a novel locus, we performed in vitro genome-wide association studies (GWAS) and further tested the result in a cohort of septic shock patients. <b><i>Methods:</i></b> Two in vitro GWAS using a quantitative trait locus analysis of stimulated IL-6 production in lymphoblastoid cells from 60 individuals of European ancestry were performed. <i>VPS13D</i> rs6685273 was genotyped in European ancestry patients (n = 498). The <i>VPS13D</i> gene was silenced in vitro. <b><i>Results:</i></b> Two GWAS using lymphoblastoid cells identified the locus of <i>VPS13D</i> rs6685273 that was significant in the same direction in both GWAS. The <i>VPS13D</i> rs6685273 C allele was associated with increased IL-6 production. Patients with septic shock who had the <i>VPS13D</i> rs6685273 CC genotype had an increased 28-day mortality (p = 0.023) and more organ failure (p < 0.05) compared to the CT/TT genotypes. <i>VPS13D</i> in vitro gene silencing in the HeLa cell line increased IL-6 production. Furthermore, the rs6685273 genotype was associated with differential <i>VPS13D</i> splice variant expression. <b><i>Conclusions:</i></b> The <i>VPS13D </i>rs6685273 C allele was associated with increased IL-6 production in vitro. The patients with the <i>VPS13D </i>rs6685273 CC genotype had increased 28-day mortality and increased organ failure. <i>VPS13D</i> appears to regulate IL-6 production.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle