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Enregistrement W2042685802 · doi:10.1159/000381265

<b><i>VPS13D</i></b> Gene Variant Is Associated with Altered IL-6 Production and Mortality in Septic Shock

2015· article· en· W2042685802 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of Innate Immunity · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Sanitarium Association
Mots-clésGenome-wide association studySeptic shockBiologyGenotypeAlleleLocus (genetics)Genetic associationGeneticsGeneMolecular biologyImmunologySingle-nucleotide polymorphismSepsis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<b><i>Background:</i></b> Genetic variations contribute to septic shock mortality. To discover a novel locus, we performed in vitro genome-wide association studies (GWAS) and further tested the result in a cohort of septic shock patients. <b><i>Methods:</i></b> Two in vitro GWAS using a quantitative trait locus analysis of stimulated IL-6 production in lymphoblastoid cells from 60 individuals of European ancestry were performed. <i>VPS13D</i> rs6685273 was genotyped in European ancestry patients (n = 498). The <i>VPS13D</i> gene was silenced in vitro. <b><i>Results:</i></b> Two GWAS using lymphoblastoid cells identified the locus of <i>VPS13D</i> rs6685273 that was significant in the same direction in both GWAS. The <i>VPS13D</i> rs6685273 C allele was associated with increased IL-6 production. Patients with septic shock who had the <i>VPS13D</i> rs6685273 CC genotype had an increased 28-day mortality (p = 0.023) and more organ failure (p < 0.05) compared to the CT/TT genotypes. <i>VPS13D</i> in vitro gene silencing in the HeLa cell line increased IL-6 production. Furthermore, the rs6685273 genotype was associated with differential <i>VPS13D</i> splice variant expression. <b><i>Conclusions:</i></b> The <i>VPS13D </i>rs6685273 C allele was associated with increased IL-6 production in vitro. The patients with the <i>VPS13D </i>rs6685273 CC genotype had increased 28-day mortality and increased organ failure. <i>VPS13D</i> appears to regulate IL-6 production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,601
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle