Osteopontin is proteolytically processed by matrix metalloproteinase 9
Notice bibliographique
Résumé
Osteopontin is robustly upregulated following myocardial infarction (MI), which suggests that it has an important role in post-MI remodeling of the left ventricle (LV). Osteopontin deletion results in increased LV dilation and worsened cardiac function. Thus, osteopontin exerts protective effects post-MI, but the mechanisms have yet to be defined. Matrix metalloproteinases (MMPs) regulate LV remodeling post-MI, and osteopontin is a known substrate for MMP-2, -3, -7, and -9, although the cleavage sites have not been mapped. Osteopontin-derived peptides can exert distinct biological functions that may depend on their cleavage sites. We mapped the MMP-9 cleavage sites via LC-MS/MS analysis using label-free and N-terminal labeling methods, and compared them with those of MMP-2, -3, and -7. Each MMP yielded a unique cleavage profile with few overlapping cleavage sites. Using synthetic peptides, we validated 3 sites for MMP-9 cleavage at amino acid positions 151-152, 193-194, and 195-196. Four peptides were synthesized based on the upstream- and downstream-generated fragments and were tested for biological activity in isolated cardiac fibroblasts. Two peptides increased cardiac fibroblast migration rates post-wounding (p < 0.05 compared with the negative control). Our study highlights the importance of osteopontin processing, and confirms that different cleavage sites generate osteopontin peptides with distinct biological functions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».