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Enregistrement W2042737747 · doi:10.1089/adt.2009.0243

Rb <sup>+</sup> Efflux Assay for Assessment of Non-Selective Cation Channel Activities

2010· article· en· W2042737747 sur OpenAlexaff
Kun Liu, Manoj Samuel, Richard K. Harrison, Jeff W. Paslay

Notice bibliographique

RevueAssay and Drug Development Technologies · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueIon Channels and Receptors
Établissements canadiensWomen's Health Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTRPC6EffluxTransient receptor potential channelChemistryBiophysicsIon channelHEK 293 cellsChannel blockerBiochemistryPharmacologyReceptorBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Transient receptor potential (TRP) channels have been found to play important roles in cellular physiology and hold promise as therapeutic targets. These channels activate in response to a variety of chemical or physical stimuli and conduct non-selective cation currents (NSCC). Due to their unique activation properties, application of automated electrophysiology to measure the channel activity has been difficult. Using HEK293 cells stably expressing human TRP channels, hTRPC6 and hTRPA1, we developed and validated a high-throughput Rb(+) efflux assay for NSCC channels. The assay was performed in cell-based 96-well format. A significant increase in Rb(+) efflux can be detected upon channel activation by specific agonists, confirming that both TRPC6 and TRPA1 channels are permeable to Rb(+) ions. The agonists induced Rb(+) efflux can be blocked by known channel blockers and selected compounds from our high-throughput screening (HTS) hits. The assay is suitable for HTS with Z' factors of 0.53 and above. We also tested the Ca(2+) effect on channel activities in this assay. Both TRPC6 and TRPA1 channels were found to be inhibited by increasing the concentration of Ca(2+) in the assay buffer. However, Ca(2+) significantly reduced the potency of allyl isothiocyanate (AITC) on TRPA1 but did not affect the potency of carbochol on TRPC6. Using this assay for secondary confirmation screen, we successfully identified and confirmed the positive hits as TRPC6 inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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