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Enregistrement W2042766259 · doi:10.1074/jbc.m505511200

Molecular Mechanisms of Cation Transport by the Renal Na+-K+-Cl- Cotransporter

2005· article· en· W2042766259 sur OpenAlexaff
Édith Gagnon, Marc J. Bergeron, Nikolas D. Daigle, Marie‐Hélène Lefoll, Paul Isenring

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCotransporterChemistryBiophysicsBiologySodiumOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Two variants of the renal Na(+)-K(+)-Cl(-) cotransporter (NKCC2), called NKCC2A and NKCC2F, display marked differences in Na(+), Rb(+), and Cl(-) affinities, yet are identical to one another except for a 23-residue membrane-associated domain that is derived from alternatively spliced exons. The proximal portion of these exons is predicted to encode the second transmembrane domain (tm2) in the form of an alpha-helix, and the distal portion, part of the following connecting segment (cs1a). In recent studies, we have taken advantage of the A-F differences in kinetic behavior to determine which regions in tm2-cs1a are involved in ion transport. Functional characterizations of chimeras in which tm2 or cs1a were interchanged between the variants showed that both regions are important in specifying ion affinities, but did not allow delineating the contribution of individual residues. Here, we have extended these structure-function analyses by studying additional mutants in which variant residues between A and F were interchanged individually in the tm2-cs1a region (amino acid number 216, 220, 223, 229, or 233 in NKCC2). None of the substitutions were found to affect K(m (C1-)), suggesting that the affinity difference for anion transport is conveyed by a combination of variant residues in this domain. However, 2 substitutions in the tm2 of F were found to affect cation constants specifically; interestingly, one of these mutations (residue 216) only affected K(m (Rb+)) while the other (residue 220) only affected K(m (Na+)). We have thus identified two novel residues in NKCC2 that play a key role in cation transport. Because such residues should be adjacent to one another on the vertical axis of the tm2 alpha-helix, our results imply, furthermore, that the ion transport sites in NKCC2 could be physically linked.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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