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Enregistrement W2042839497 · doi:10.1167/iovs.04-0951

Altered Gene Expression of Angiogenic Factors Induced by Calcium-Mediated Dissociation of Retinal Pigment Epithelial Cells

2005· article· en· W2042839497 sur OpenAlexaff
Xuefeng Wang, Jing Cui, Shiv S. Prasad, Joanne A. Matsubara

Notice bibliographique

RevueInvestigative Ophthalmology & Visual Science · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPEDFVascular endothelial growth factorMolecular biologyGene expressionCalciumVascular endothelial growth factor AChemistryRetinal pigment epitheliumBiologyCell cultureCell biologyRetinalCancer researchGeneBiochemistryVEGF receptors

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: To examine the effect of loss of cell-cell contacts on the gene expression of vascular endothelial growth factor (VEGF) and other factors in primary culture of human retinal pigment epithelial (RPE) cells with real-time reverse transcription-PCR. METHODS: The dissociation of postconfluent RPE cells was induced by calcium chelation, low-calcium medium, anti-E-cadherin, and anti-N-cadherin antibodies. Total RNA was isolated from the cultured RPE cells and reverse transcribed to cDNA. VEGF was quantified by real-time PCR with a fluorescence detector. VEGF isoforms were differentially measured by specific exon-spanning primers. Besides VEGF, the gene expression levels of some other growth factors were also examined in calcium-mediated dissociation. RESULTS: Disruption of cell-cell contacts of RPE cells was induced by calcium chelation and low-calcium medium, but not by anti-E-cadherin and anti-N-cadherin antibodies. Calcium-mediated dissociation of RPE cells significantly increased the gene expression levels of VEGF. The mRNA levels of VEGF increased by 6.3-fold on treatment with EGTA and by 4.7-fold in the low-calcium medium at 6 hours. Splice variants of VEGF showed the differential pattern of gene expression. Whereas the expression of VEGF(121) and VEGF(165) was upregulated on calcium-induced dissociation of RPE cells, that of VEGF(145) and VEGF(189) was unchanged. VEGF(206) was not detected. On calcium-induced dissociation, bFGF, IL-6, matrix metalloproteinase (MMP)-1, and placental growth factor (PlGF) were upregulated, whereas acidic (a)FGF and pigment epithelium-derived factor (PEDF) were both downregulated. CONCLUSIONS: The results show that loss of intercellular contacts promotes increased gene expression of VEGF and other angiogenic factors in human RPE cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,637

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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